MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis HD-789 plasmid p02

Total Repeats: 5338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018509	AT	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018509	TTG	2	6	37	42	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018509	CATTTG	2	12	172	183	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_018509	CAG	2	6	220	225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018509	ACC	2	6	227	232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_018509	CTT	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018509	CAGGAA	2	12	394	405	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_018509	T	6	6	424	429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018509	ATT	2	6	497	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018509	T	6	6	512	517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018509	AAGG	2	8	654	661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018509	CTC	2	6	693	698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_018509	CTAA	2	8	700	707	50 %	25 %	0 %	25 %	434379281
14	NC_018509	CATAGT	2	12	810	821	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	434379281
15	NC_018509	ATT	2	6	910	915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379281
16	NC_018509	TGT	2	6	921	926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379281
17	NC_018509	AATC	2	8	1011	1018	50 %	25 %	0 %	25 %	434379281
18	NC_018509	GAA	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379281
19	NC_018509	AAT	2	6	1124	1129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379281
20	NC_018509	AAG	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379281
21	NC_018509	CCTT	2	8	1280	1287	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
22	NC_018509	GTT	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379281
23	NC_018509	TCT	2	6	1377	1382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
24	NC_018509	ATAC	2	8	1408	1415	50 %	25 %	0 %	25 %	434379281
25	NC_018509	CCA	2	6	1511	1516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379281
26	NC_018509	TTG	2	6	1539	1544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379281
27	NC_018509	AAC	2	6	1555	1560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379281
28	NC_018509	TTAGG	2	10	1575	1584	20 %	40 %	40 %	0 %	434379281
29	NC_018509	CT	3	6	1628	1633	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
30	NC_018509	TAT	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379281
31	NC_018509	TCT	3	9	1685	1693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
32	NC_018509	AAC	2	6	1756	1761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379281
33	NC_018509	CTC	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379281
34	NC_018509	GAA	2	6	1789	1794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379281
35	NC_018509	CT	3	6	1862	1867	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
36	NC_018509	TTC	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
37	NC_018509	TGT	2	6	1903	1908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379281
38	NC_018509	TTA	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379281
39	NC_018509	GTTT	2	8	1937	1944	0 %	75 %	25 %	0 %	434379281
40	NC_018509	AGT	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379281
41	NC_018509	CTT	2	6	2121	2126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
42	NC_018509	TTC	2	6	2207	2212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
43	NC_018509	AATTT	2	10	2222	2231	40 %	60 %	0 %	0 %	434379281
44	NC_018509	ATTA	2	8	2242	2249	50 %	50 %	0 %	0 %	434379281
45	NC_018509	TCA	2	6	2339	2344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379281
46	NC_018509	ACA	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379281
47	NC_018509	TCT	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
48	NC_018509	TCT	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
49	NC_018509	ATC	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379281
50	NC_018509	CAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379281
51	NC_018509	TC	3	6	2627	2632	0 %	50 %	0 %	50 %	434379281
52	NC_018509	TTTA	2	8	2638	2645	25 %	75 %	0 %	0 %	434379281
53	NC_018509	TTC	2	6	2692	2697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379281
54	NC_018509	TCTGT	2	10	2769	2778	0 %	60 %	20 %	20 %	434379282
55	NC_018509	GTG	2	6	2808	2813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434379282
56	NC_018509	GAA	2	6	2820	2825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379282
57	NC_018509	TCT	2	6	2837	2842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
58	NC_018509	GTT	2	6	2843	2848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379282
59	NC_018509	TTTG	2	8	2913	2920	0 %	75 %	25 %	0 %	434379282
60	NC_018509	TCGTTA	2	12	2951	2962	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	434379282
61	NC_018509	TGT	2	6	3008	3013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379282
62	NC_018509	GAAA	2	8	3043	3050	75 %	0 %	25 %	0 %	434379282
63	NC_018509	ACTT	2	8	3079	3086	25 %	50 %	0 %	25 %	434379282
64	NC_018509	AGG	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379282
65	NC_018509	ATA	2	6	3203	3208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379282
66	NC_018509	T	6	6	3262	3267	0 %	100 %	0 %	0 %	434379282
67	NC_018509	TCA	2	6	3308	3313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379282
68	NC_018509	T	6	6	3368	3373	0 %	100 %	0 %	0 %	434379282
69	NC_018509	CTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
70	NC_018509	AAAT	2	8	3520	3527	75 %	25 %	0 %	0 %	434379282
71	NC_018509	CAT	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379282
72	NC_018509	GAATA	2	10	3630	3639	60 %	20 %	20 %	0 %	434379282
73	NC_018509	GCA	2	6	3665	3670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379282
74	NC_018509	CAT	2	6	3777	3782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379282
75	NC_018509	CTT	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
76	NC_018509	CT	3	6	3806	3811	0 %	50 %	0 %	50 %	434379282
77	NC_018509	ATC	2	6	3874	3879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379282
78	NC_018509	GAA	2	6	3893	3898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379282
79	NC_018509	ATA	2	6	3949	3954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379282
80	NC_018509	CTT	2	6	4044	4049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
81	NC_018509	GT	3	6	4050	4055	0 %	50 %	50 %	0 %	434379282
82	NC_018509	TAAA	2	8	4126	4133	75 %	25 %	0 %	0 %	434379282
83	NC_018509	GTT	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379282
84	NC_018509	TCT	2	6	4151	4156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
85	NC_018509	ACGA	2	8	4195	4202	50 %	0 %	25 %	25 %	434379282
86	NC_018509	CCA	2	6	4248	4253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379282
87	NC_018509	TTG	3	9	4313	4321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379282
88	NC_018509	CTT	2	6	4440	4445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379282
89	NC_018509	ACT	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379282
90	NC_018509	TGCT	2	8	4474	4481	0 %	50 %	25 %	25 %	434379282
91	NC_018509	CT	3	6	4492	4497	0 %	50 %	0 %	50 %	434379282
92	NC_018509	CAC	2	6	4600	4605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434379283
93	NC_018509	TCA	2	6	4610	4615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379283
94	NC_018509	AAC	2	6	4675	4680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379283
95	NC_018509	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379283
96	NC_018509	TAA	2	6	4715	4720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379283
97	NC_018509	TTC	2	6	4760	4765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379283
98	NC_018509	TGT	2	6	4864	4869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379283
99	NC_018509	GAA	2	6	4900	4905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379283
100	NC_018509	CCT	2	6	4925	4930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434379283
101	NC_018509	CT	3	6	4997	5002	0 %	50 %	0 %	50 %	434379283
102	NC_018509	TTGT	2	8	5014	5021	0 %	75 %	25 %	0 %	434379283
103	NC_018509	CAA	2	6	5025	5030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434379283
104	NC_018509	AGC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434379283
105	NC_018509	CT	4	8	5223	5230	0 %	50 %	0 %	50 %	434379283
106	NC_018509	TTG	2	6	5264	5269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379283
107	NC_018509	TAT	2	6	5283	5288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434379283
108	NC_018509	TCA	2	6	5291	5296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379283
109	NC_018509	GAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379283
110	NC_018509	GAA	2	6	5379	5384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379283
111	NC_018509	TCT	2	6	5414	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379283
112	NC_018509	GTA	2	6	5428	5433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379283
113	NC_018509	GGA	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434379283
114	NC_018509	TTGC	2	8	5738	5745	0 %	50 %	25 %	25 %	434379283
115	NC_018509	TCC	2	6	5772	5777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018509	GTT	2	6	5786	5791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379284
117	NC_018509	T	6	6	5805	5810	0 %	100 %	0 %	0 %	434379284
118	NC_018509	CTG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434379284
119	NC_018509	AGA	2	6	5928	5933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379284
120	NC_018509	TAA	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379284
121	NC_018509	CTT	3	9	6023	6031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379284
122	NC_018509	GA	3	6	6104	6109	50 %	0 %	50 %	0 %	434379284
123	NC_018509	TTTG	2	8	6130	6137	0 %	75 %	25 %	0 %	434379284
124	NC_018509	AGT	2	6	6165	6170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379284
125	NC_018509	TTC	2	6	6174	6179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379284
126	NC_018509	GAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434379284
127	NC_018509	CTA	2	6	6329	6334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379284
128	NC_018509	GTA	2	6	6363	6368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379284
129	NC_018509	CTT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434379284
130	NC_018509	ACCTGT	2	12	6417	6428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	434379284
131	NC_018509	TTTC	2	8	6465	6472	0 %	75 %	0 %	25 %	434379284
132	NC_018509	AGT	2	6	6514	6519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434379284
133	NC_018509	GGTC	2	8	6562	6569	0 %	25 %	50 %	25 %	434379284
134	NC_018509	TAGA	2	8	6609	6616	50 %	25 %	25 %	0 %	434379284
135	NC_018509	CAGATA	2	12	6680	6691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	434379284
136	NC_018509	AAT	2	6	6695	6700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434379284
137	NC_018509	GTT	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379284
138	NC_018509	TCC	2	6	6735	6740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018509	ATC	2	6	6816	6821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434379285
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141	NC_018509	GTT	2	6	6895	6900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434379285
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157	NC_018509	TA	3	6	7936	7941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018509	AT	3	6	7950	7955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_018509	GTGCT	2	10	13055	13064	0 %	40 %	40 %	20 %	434379289
271	NC_018509	AT	3	6	13158	13163	50 %	50 %	0 %	0 %	434379289
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